中西医结合诊治慢性胃炎数据库的构建及应用
这是一篇关于中西医结合,慢性胃炎,数据库,知识图谱,中医证型的论文, 主要内容为目的:通过构建中西医结合诊治慢性胃炎数据库,对慢性胃炎(Chronic Gastritis,CG)病例实行科学化、规范化的储存、管理,借助数据库数据检索、导出等功能开展回顾性研究,探索中医师治疗CG的用药规律,也为寻找中医学与现代医学诊疗方面的对接进行有益的探索,为CG的中医辨证分型提供客观依据。方法:(一)数据库构建:经过前期的大量文献学习,参照专家共识及我院慢性胃炎优势病种诊疗方案,结合地域特征以及科研、临床工作的需求,制定了规范统一的数据库字段并构建广东省中医院脾胃病科慢性胃炎患者门诊病例信息收集模版。详细采集患者基本信息、四诊信息、病史、相关辅助检查、中西医诊断及治疗方案等信息资料后,对其进行初步数据清洗。随后,借助于R Studio公司开发R shiny包建立中西医结合诊治慢性胃炎数据库,并对4546例慢性胃炎的病例资料实现科学化、规范化的储存、管理。(二)数据库应用:1.利用中西医结合诊治慢性胃炎数据库收集2018年1月至2019年10月间广东省中医院脾胃病科CG患者的门诊病案资料,运用计算机机器学习算法以及人机结合构建知识图谱的方法学习中医师在辨证论治CG方面的组方用药规律。2.利用数据库收集190例幽门螺旋杆菌(Helicobacter Pylori,Hp)相关慢性胃炎的病例资料展开回顾性分析,探究中医证型与CYP2C19基因多态性、Hp耐药基因的相关性。结果:(一)建成中西医结合诊治慢性胃炎数据库。目前数据库一共收录20323诊次、4546例患者的病例资料,储存的病例资料内容涵盖患者基本信息、四诊信息,相关病史、辅助检查结果以及详细的中西医治疗用药方案。数据库具有基础的数据储存、检索、查看等病例管理功能以及基于自然语义的数据清洗、数据可视化分析等功能,能够满足高效开展中医药诊治CG相关的临床、科研工作的需求。(二)基于中西医结合诊治慢性胃炎数据库展开初步应用,测试数据库的可行性,探索数据库的应用前景。结果显示:1.中西医结合诊治慢性胃炎数据库信息全面,操作简便,在科研应用中能够为统计工作提供准确性、可靠性的数据,是提高临床、科研工作的效率及质量的实用工具。2.数据库中2018年1月至2019年10月间广东省中医院慢性胃炎优势病种团队接诊的2312例慢性胃炎门诊患者中出现最多的症状分别为上腹胀、嗳气、上腹痛、反酸、胃纳差。病案中出现次数最多的中医证型前五位分别为脾胃气虚、脾虚湿阻化热证、肝郁脾虚证、胃阴不足证、脾胃虚寒证。7796张中医处方共涉及192味中药,其中使用频率最高的中药为党参、炙甘草、木香、法半夏、陈皮、砂仁、延胡索、厚朴、茯苓、白术。计算机提取出全知识元的数量共10985个,其中核心知识元共248个。计算机运用K-Means聚类分析将核心知识元分为了 6个类簇并将结果以知识图谱形式展现。构建的诊疗知识图谱显示对于气虚血弱的面色萎黄患者,临床医师多选用黄芪、当归益气生血;对于阴虚便秘患者,临床医师多选择北沙参、石斛、玄参、墨旱莲、柏子等药物滋阴、润肠;对于脾胃虚弱的胃纳差、消瘦患者,多以山药、炒稻芽补益脾气、健脾开胃等。3.数据库中190例Hp相关慢性胃炎患者的CYP2C19*1、CYP2C19*2、CYP2C19*3基因分别占比58.7%、33.4%及7.9%,CYP2C19*1/*1、CYP2C19*1/*2、CYP2C19*1/*3、CYP2C19*2/*2、CYP2C19*2/*3 的分布频率分别为 41.1%、23.7%、11.6%、19.5%、4.1%。快代谢型(EM)、中代谢型(IM)、慢代谢型(PM)的出现频率分别为41.1%、35.2%、23.7%。相比其它证型,脾胃湿热证的患者更多为IM或PM而不是EM(P<0.001);相比与虚证患者,实证患者中IM及PM更多,而EM更少(P=0-008)。Hp菌株对甲硝唑、克拉霉素、盐酸左氧氟沙星、四环素、呋喃唑酮、阿莫西林耐药的耐药率分别为100.0%、63.7%、50.5%、31.1%、23.2%、10.0%。Hp菌株对两种抗生素产生耐药的比例达到31.1%,对三种或三种以上抗生素耐药的比例高达58.9%。脾虚湿阻化热证患者的gyrA-RDR及parC基因突变率显著较其它证型的突变率低(P=0.050),脾胃虚弱证及脾胃湿热证患者的16S rRNA基因突变率突变率显著高于肝胃不和证、寒热错杂证、胃阴不足证及胃络瘀阻证的突变率(P=0.037)。不同证型患者的23S rRNA、PBP1以及porD,oorD基因突变率差异均无统计意义(P=0.808、0.894、0.490)。结论:1.基于R shiny搭建的中西医结合诊治慢性胃炎数据库能够全面收集、安全储存大量的病例信息。数据库应用简单、可操作性强,方便知识检索,有利于临床数据的充分开发与利用,为临床病例管理、科研工作开展提供了极大的便利。2.中医药治疗CG知识图谱揭示了以传承岭南梁氏脾胃病学术流派思想为主的广东省中医院慢性胃炎优势病种团队辨证治疗CG的用药规律,发现CG的治疗总以补益脾胃为主,辅以调理气机,滋阴、疏肝、清胃也是CG的常用治法。临床中医师注重辨病与辨证的结合,在把握整体治疗方向的同时也通过辨证加减用药以兼顾不同证型患者的相兼症状。3.Hp相关慢性胃炎患者中的CYP2C19代谢型总体以EM分布最多。中医证型与CYP2C19基因多态性具有相关性,脾胃湿热证及实证的患者相对有更多的IM与PM。Hp与甲硝唑、克拉霉素、盐酸左氧氟沙星耐药相关的基因突变率均超过50%,超过一半的Hp菌株是多重耐药的。中医证型与gryA-RDR或parC基因、16S rRNA基因的突变具有一定相关性,而与23S rRNA、PBP1以及porD,oorD基因的突变不相关。
中西医结合乳腺癌病例数据库的构建及初步应用
这是一篇关于乳腺癌,数据库,中西医结合的论文, 主要内容为目的:构建乳腺癌病例数据库,以科学规范地储存及管理患者的病例资源,更好地完成健康管理及随访,同时能高效、充分地挖掘病例资源以满足我院临床研究和医学转化研究的需求,深化与其他乳腺病中心的合作与交流。方法:结合临床及科研实际需要,经专家组讨论后按需求分析筛选出有价值的字段信息,参考常规诊疗规范及乳腺癌权威指南共识对字段描述进行规范,并按板块化对信息进行分类归纳整理,同时与技术人员沟通数据库设计的可行性,最后再经专家组讨论生成合理的、认可度高的乳腺癌病例数据库字段设计表;接着采用浏览器/服务器(Browser/Server,B/S)模式为数据库架构,前台以动态网页展示,后台采用关系型数据库管理系统(MySQL)储存及管理乳腺癌患者病例资料;最后收集从2013年1月至2013年12月期间广东省中医院大学城医院乳腺科收治的可手术乳腺癌患者病例信息,对数据进行可行性及功能性测试。成果:设计的中西医结合乳腺癌数据库结构合理,信息全面,操作简便,集储存、管理、统计、共享功能于一身,且能实现智能分析、实时同步更新数据,并具有安全性好,扩展性佳,便于推广的特点。结论:构建乳腺癌病例数据库,有助于临床资料全面、规范地记录及储存,有利于临床健康管理、随访工作的开展。同时为数据的对比、分析提供方便快捷的信息服务,有利于临床数据的开发和利用,以进一步为临床实践提供决策依据。
基于OCR的中西医结合诊断系统的设计与实现
这是一篇关于智能诊断,文本检测,文本识别,中西医结合,高脂血症的论文, 主要内容为血脂异常是一种慢性疾病,能够引发糖尿病、中风和其他心血管疾病,当前,“看病难”“看病贵”的问题仍旧存在,高脂血症患者人数却不断攀升,患者渴望得到及时诊断和治疗的需求难以满足。西医通过使用化学药物治疗高脂血症,但是会产生副作用和不良反应,中医历史悠久且理论丰富,中医的高脂血症治疗体系也正在不断完善。随着大数据、深度学习算法和计算机软硬件等技术的不断发展和不断突破,人工智能与各个行业领域间不断融合,提供了行业发展新思路。基于上述情况,中西医结合诊断系统将人工智能技术与医疗领域相结合,采集病人的舌象特征、判断病人的患病程度以及识别病人的血检数据,为患者提供高脂血症的线上诊断和治疗服务。本系统以微信小程序端作为移动客户端,网页端采用Vue.js框架,后端分为业务处理服务器端和化验单处理服务器端,分别采用Spring Boot框架和Flask框架,数据库采用Mysql数据库。本系统基本功能模块有用户中心模块、智能诊断模块、发现用户模块、聊天咨询模块和系统管理模块,本人完成了整个系统的设计与实现,在聊天咨询模块中通过Web Socket实现了即时聊天中的心跳机制和离线机制。本系统中OCR技术的实现使用了CTPN模型从化验单表格中检测文本框和CRNN模型对表格中的文本框进行文本识别。为了提升化验单检测与识别的精度,算法的创新包括:(1)在化验单文本检测过程中加入了对化验单图片的表格提取预处理和表格还原后处理;(2)在化验单文本识别算法中使用Dense Net在卷积层进行特征提取并使用医疗词典在转录层进行文本纠正。化验单文本检测算法m AP达到92%,化验单文本识别算法准确率达到88%。本系统现已完成全部开发并处于稳定运行,满足了使人们轻松获得中西医结合的高脂血症诊断服务的需求,增强了现代中医的服务能力,为中西医智能发展提供更多可能。
中西医结合乳腺癌病例数据库的构建及初步应用
这是一篇关于乳腺癌,数据库,中西医结合的论文, 主要内容为目的:构建乳腺癌病例数据库,以科学规范地储存及管理患者的病例资源,更好地完成健康管理及随访,同时能高效、充分地挖掘病例资源以满足我院临床研究和医学转化研究的需求,深化与其他乳腺病中心的合作与交流。方法:结合临床及科研实际需要,经专家组讨论后按需求分析筛选出有价值的字段信息,参考常规诊疗规范及乳腺癌权威指南共识对字段描述进行规范,并按板块化对信息进行分类归纳整理,同时与技术人员沟通数据库设计的可行性,最后再经专家组讨论生成合理的、认可度高的乳腺癌病例数据库字段设计表;接着采用浏览器/服务器(Browser/Server,B/S)模式为数据库架构,前台以动态网页展示,后台采用关系型数据库管理系统(MySQL)储存及管理乳腺癌患者病例资料;最后收集从2013年1月至2013年12月期间广东省中医院大学城医院乳腺科收治的可手术乳腺癌患者病例信息,对数据进行可行性及功能性测试。成果:设计的中西医结合乳腺癌数据库结构合理,信息全面,操作简便,集储存、管理、统计、共享功能于一身,且能实现智能分析、实时同步更新数据,并具有安全性好,扩展性佳,便于推广的特点。结论:构建乳腺癌病例数据库,有助于临床资料全面、规范地记录及储存,有利于临床健康管理、随访工作的开展。同时为数据的对比、分析提供方便快捷的信息服务,有利于临床数据的开发和利用,以进一步为临床实践提供决策依据。
肺系疾病中西医病名关联映射及知识图谱构建研究
这是一篇关于中西医结合,中西医病名映射,知识图谱,肺系疾病的论文, 主要内容为积极推进中西医创新融合和深层次互联互通,是我国医学领域发展的大势所趋。然而,中西医对相同(或相近)疾病的称谓不同,严重阻碍了中西医交流。在中西医结合乃至中西医知识深度融合的道路上,关联映射中西医病名、合理有序地整合中西医知识是亟需解决的关键问题。本研究提出了改进模式匹配的中西医疾病名称关联映射算法,基于算法开发系统实现科技文献肺系疾病中西医病名对应关系的自动抽取。总结了 28个有效的特征词,对后续研究及机器学习算法开发有参考价值。肺系疾病中西医病名关联映射是肺系疾病中西医知识图谱构建的基础。以疾病名称搭建中西医知识的语义关联,对中医知识和西医知识进行多维度的梳理,分别定义了 10个中医顶层大类和西医顶层大类,及66种中医语义关系和63种西医语义关系,对概念及概念间关系进行揭示,构建肺系疾病中西医知识模型。从高质量的科技文献中抽取中西医知识,提出了基于SemRep的肺系疾病西医知识抽取方法及基于特征词匹配的肺系疾病中医知识抽取方法,以语义三元组“<主语>|<谓语>|<宾语>”的形式存储。对不同来源的中西医知识进行实体对齐和关系融合,利用D3.js绘制直观的可视化图谱。利用基于规则的方法对西医疾病与中医方剂之间治疗关系进行知识推理,为临床诊疗提供新思路和借鉴参考。本研究提出的中西医疾病名称关联映射算法,适合处理大规模文献,效率较高,使自动化提取中西医疾病名称对应关系成为可能。构建肺系疾病中西医知识图谱,探索中西医知识组织与整合模式,为中西医知识体系深度融合提供了思路参考和理论借鉴。中西医整合知识图谱通过对科技文献所蕴含的病因、治疗等语义关系的深度揭示及图形化直观呈现,有助于临床诊疗决策系统等智能应用的开发与推广。
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